國盟成員黨之一的伊斯蘭黨在甫於11月19日落幕的第15屆全國大選中，總共角逐64個國會議席，結果成功拿下43個席位，比在上屆大選所奪得的18席多了25席，增長了172%，成為本屆大選中最大的贏家，也凸顯本屆大選後一個深層的隱患，即伊斯蘭民族主義的興起。
伊黨不僅本身戰績彪炳，而且還協助同一陣線的土著團結黨在所競選的86個議席中奪得30席。根據報道，土團黨奪下的議席，主要是得力於伊黨支持者的協助，這使得國盟總共獲得73個國會議席，僅次於希望聯盟的82席，並且導致本屆大選首次出現懸峙議會的局面。
伊斯蘭民族主義坐大
本屆大選最令人矚目的是伊斯蘭民族主義的坐大。雖然國盟主席丹斯裏慕尤丁在11月23日覲見元首時自稱擁有115個簡單多數議席，惟元首還是獻議國盟與希盟聯合組織團結政府。有人將之解讀為那是因為元首不想讓伊黨執政，其實倘若慕尤丁當下接受元首的獻議，伊黨便會是政府成員。
任何一個宗教民族主義的產生，主要是因為宗教的發展，會衍生出一種基於宗教意識或者是宗教精神的民族主義運動。這一運動通常被稱為宗教民族主義，它通過一定的方式將民族與宗教緊密地捆綁在一起，以達到某種具有衝突性的政治目的。
1993年，尤根斯邁耶在《新冷戰—宗教民族主義對抗世俗國家》一書中提到，宗教民族主義在許多國家興起，這是對世俗民族主義失敗，即未能兌現諾言的 “政治自由、經濟繁榮和社會公正” ，以及對世俗道德腐敗的一種反應，並形成對世俗民族主義的嚴峻挑戰。
此次大選結果，恰恰應驗了尤根斯邁耶所言。很顯然的，各族選民都對以巫統為主的國陣感覺徹底失望。他們斷然拒絕貪汙腐敗的決心，導致由拿督斯裏阿末紮希所領導的國陣尤其是巫統蒙受建黨以來最慘重的失敗。
土著回教徒和非回教徒選民分別把選票集中投給國盟和希盟，唾棄法庭幫的巫統，影響所及，其他國陣成員黨如馬華和國大黨也遭受池魚之殃。
安華須消除種族偏見
以馬來回教徒占多數的軍警人員和其他公務員，多數都把票投給了國盟。以公務員選民居首的布城國會議席，國盟的土團黨擊敗巫統即可見一斑。
這個趨勢也讓宗教民族主義在全國興起，原本非回教徒和回教徒選民在投票中各取所需，分投希盟和國盟。如果國盟遵循元首的勸告與希盟組織團結政府就皆大歡喜，但隨著慕尤丁婉拒元首的獻議，導致兩大陣營對峙，無形中加劇了族群的分裂和宗教的對立。
大選成績讓許多民眾包括非回教徒和一些溫和與中庸的馬來回教徒都擔心我國會變成第二個伊朗。因此，在安華宣誓成為首相後紛紛建議采取相應對策阻遏宗教政治化。
有人建議新政府應將宗教與政黨政治切割，禁止政黨利用宗教來遂其政治目的。惟此舉無異於敲冰求火，特別是像馬來西亞這樣一個以馬來回教徒族群占大多數的國家。任何強製的鎮壓行動必將引發劇烈的反彈，整個國家將陷入動蕩不安的局面。
安華是馬來西亞伊斯蘭青年組織的聯合創辦人，他在1982年受時任首相敦馬哈迪邀請加入巫統後，曾於80年代推動國家行政伊斯蘭化的政策，並在擔任教育部長期間在教育界采納了伊斯蘭化措施，這是眾所周知的事。
解鈴還須係鈴人，在擔任第10任首相的五年期間，他必須消除馬來回教徒對非回教徒的種族偏見，並消除非回教徒對伊斯蘭化的恐懼感，同時結合溫和與中庸派回教徒的力量，消弭這種不健康的趨勢。
安華在擔任副首相時，曾舉辦馬來西亞第一次回儒對話。那次與會者超出1000人，國內的許多回教徒知識分子紛紛響應參加。
後來馬來亞大學還成立了一個文明對話研究中心，專門討論伊斯蘭與儒學乃至中國文化互動的可能性等問題。是故，在促進文化交流與族群融合方面，他應該是駕輕就熟的。
